我所始建于1937年，是国内唯一成建制专业从事中药材种植研究的公益一类科研机构，是全国中医药文化宣传教育基地、国家中医药优势特色教育培训基地、国家中医药健康旅游示范基地、重庆市科普教育基地。

开展药物种植研究，促进卫生事业发展；药用动植物资源调查及收集；动植物野变家种；病虫害防治；提高中药材质量、产量和标准化研究，开展生产与开发。

现有在编人员125名（编制150名），其中高级专业技术人员31人，占科技人员比例45%以上。拥有国务院政府特殊津贴专家3人、神农学者1人，重庆英才等市级人才称号8人，南川区“金山英才”12人，构建了一支高素质的科研梯队。

建有重庆金佛山喀斯特生态系统国家野外科学观测研究站、国家级博士后科研工作站等2个国家级科研平台，以及“刘正宇全国名老中医药专家传承工作室”、“胡开治全国老药工传承工作室”、“朱照静全国老药工传承工作室”3个传承工作室。同时，打造了包括6个省部级科研平台、4个省部级科技服务平台、重庆市新型中药活性产物技术创新中心、重庆市陆生野生动物救护站在内的10余个省部级支撑平台，是药用植物学（国家级）和中药资源学（市级）等5个重点学科的建设单位。

建所以来，率先开展天麻、林麝、白及、灵芝、黄精等200余种中药材种养殖及规范化生产技术研究，首创天麻野生变家栽、人工活麝取香等关键技术。累计获得国家级科技成果奖4项、省部级科技成果奖60项；发表科研论文近1200篇；制定发布标准40项；发现植物新物种113个及数十个新分布植物；出版专著90部；授权有效专利41件、地理标志证明商标2项，为卫生健康事业提供了重要科技支撑。

研究所本部位于重庆市南川区三泉镇，占地180亩，（科研用房2.8万㎡（含1.2万㎡在建工程）。拥有洋圩坪（海拔1500-1750m）、槐坪（海拔500-850m）、华耳寺（海拔600-800m）及所本部重庆药用植物园四个科研与物种保存及科普展示基地，面积1800亩，种植保存药用植物2000余种。建有生药标本馆和腊叶标本馆，馆藏生药标本5000余份、腊叶标本35万余份，其中模式标本200余份，为中药材种质资源保存与研究奠定了坚实基础。