重庆市药物种植研究所始建于1937年，是国内唯一成建制专业从事中药材种植研究的公益一类科研机构，是中国医学科学院药用植物研究所重庆分所，也是全国中医药文化宣传教育基地、国家中医药优势特色教育培训基地、国家中医药健康旅游示范基地、国家3A级景区。主要职责是：开展药物种植研究，促进卫生事业发展；药用动植物资源调查及收集；动植物野变家种；病虫害防治；提高中药材质量、产量和标准化研究，开展生产与开发。

研究所编制150名、在编人员130名，其中国务院政府特殊津贴专家3人、神农学者1人、“西部之光”访问学者2人、重庆英才青年拔尖人才1人、“重庆英才创新创业示范团队”3个、重庆市学术技术带头人1人、后备人才1人，南川区“金山英才”12人。

研究所在建1个国家级科研平台，建有5个省部级科研平台、4个省部级科技服务平台和1个博士后科研工作站、1个重庆市陆生野生动物救护站、1个“全国名老中医药专家（刘正宇）传承工作室”、1个“胡开治全国老药工传承工作室”。建有1个国家级、4个市级重点学科。

研究所累计开展项目1100余项，在全国首创天麻野生变家栽、人工活麝取香等技术；主持或参与发布标准166项，发表科研论文近1200篇、主编参编专著85部，获得国家级科技成果奖4项、省部级科技成果奖60项，拥有有效专利34件、地理标志证明商标2项，发布植物新物种113个以及数十个新分布植物，开展了白及、天麻、黄精、林麝等200余种中药材种养殖及规范化生产技术研究，其中白及组培技术的应用，在云南打造了十亿级产业。

研究所本部位于重庆市南川区三泉镇，占地1400余亩，其中基地面积1000余亩，科研用房2.8万㎡（含1.2万㎡在建工程）。拥有洋芋坪（海拔1500-1750m）、槐坪（海拔850-1000m）、华尔寺（海拔600-800m）及所本部重庆药用植物园四个科研与物种保存及科普展示基地，种植药用植物2000余种。建有生药标本馆和腊叶标本馆，馆藏生药标本5000余份、腊叶标本35万余份，其中模式标本200余份。

展望未来，研究所将落实好“守好土、育好人、种好药、赋好能、助好力”的“五个好”使命，努力构建“五位一体”（世界层面、国家层面、市级层面、区级层面、所级层面）全面服务体系，努力将研究所建设成药物种植“第一研究所”。