2011年—2020年

2012年

6月8日，市科委主任钟志华，市卫生局局长屈谦，南川区委书记谭家玲，区长曹清尧等领导到重庆药研所调研，分析了药研所发展中亟待解决的一些问题。

9月11日上午，市委常委、常务副市长马正其召集市级有关部门和南川区党政负责人现场召开研究重庆药研所发展的专题会议，并形成了市政府专题会议纪要。

12月11日，重庆市药物种植研究所酉阳分所成立。之后相继建立几个分所。

12月24日上午，重庆药研所行政隶属关系由卫生局移交科委的交接仪式举行。双方签订了交接备忘录。

2013年

8月2日，香港赵中振、陈虎彪教授、台湾张永勋教授、何玉铃副教授、美国白效龙（Eric Brand)先生等国际知名专家来重庆药研所考察交流。

8月16日，重庆药研所与云南省思茅云岭药材开发有限公司签订 “白及组织培养育苗技术”协议，技术转让费60万元。

9月16日，重庆药研所与贵州乾琳中药发展有限公司签订“白及组织培养育苗技术”转让协议，转让费40万元。

10月10日，重庆药研所研究员刘正宇获授牌，被中国中医科学院中药资源中心聘任为神农讲座学者。

11月，重庆药研所成为中国医学科学院药用植物研究所重庆分所，药用植物标本园也成功纳入国家药用植物园体系建设。

12月27日上午，重庆药研所隆重举行“中国医学科学院药用植物研究所重庆分所”挂牌仪式。

2014年

10月24日， 药研所承办的“中国中医药信息研究会中医药研究开与咨询专业委员会”学术交流会暨“2014药植论坛”隆重召开。

12月，重庆药研所被确定为国家中医药优势特色教育培训基地。

2015年

6月，重庆药研所被确定为全国中医药文化宣传教育基地。

7月，重庆药研所取得国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证，批准开展驯养繁殖国家一级保护野生动物林麝。

2016年

1月27日，重庆药研所申请的“南川天麻”正式成为国家地理标志证明商标。

9月6-9日，重庆药研所专家团队赴西藏昌都考察，并签署了战略合作协议，成为首个与昌都市合作协议的科技援藏院所。

2017年

3月27日，重庆药研所林麝研究团队研发的“一种人工取麝香的方法”获得国家发明专利授权。结束了重庆药研所在林麝养殖方面拥有核心技术但无专利的历史。

4月，承办“全国中药特色技术传承人才培训2017年第一期培训班”。

5月9日，承办“2017年重庆市专业技术知识更新工程中药材规范化种植（养殖）技术培训高级研修班”。

10月，承办“2017全国植物健康峰会”。

10月，重庆市药用植物园成果申报AAA景区。

2018年

4月，成功申报“国家中医药健康旅游示范基地”。

10月29日，市科技局局长许洪斌来所调研指导工作。

11月，我所发现3个新物种被王文采院士确认并发表。

2019年

3月21日，清华大学药学院院长丁胜来所考察指导工作。

4月24日，国家专利导航（重庆）研究和推广中心产业专利导航中心道地药材专利导航分中心授牌。

5月，承办重庆市现代山地特色高效农业技术体系中药材产业技术体系培训。

7月，台湾中国医药大学张永勋教授来所考察。

10月，与海南大学任明迅教授团队联合发表两个新物种“正宇梅花草”、“四面山梅花草”。

11月20日，法国国家药学科学院外籍院士、北京中医药大学林瑞超教授来所调研。

11月，我所竭航同志入选首批重庆英才·青年拔尖人才计划。

2020年

2月27日，重庆市药物种植研究所改扩建项目纳入2020年市级重大项目建设名单。

5月5日，“一种南川百合的繁殖方法”获奖发明专利授权。

5月9日，中国民主建国会重庆委员会一级巡视员、专职副主委杨亚丽来所调研。

7月23日，所歌“捧把百草在手上”荣获2019年中医药健康文化精品遴选活动机构优秀标识。

7月21日，我所“南川大白及”荣获国家地理标志证明商标。

12月29日，与西南大学、金佛山国家级自然保护区管理局联合申报的重庆金佛山喀斯特生态系统野外科学观测研究站纳入科技部公布的69个国家野外科学观测站择优建设名单。